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中國種子性狀數(shù)據(jù)庫:彌補全球數(shù)據(jù)空白的關鍵一步

媒體:原創(chuàng)  作者:植物園聯(lián)盟
專業(yè)號:植物園聯(lián)盟 2025/6/18 14:47:57

植物性狀是表征環(huán)境適應策略與資源分配模式的關鍵指標,為理解物種分布、群落構建及生態(tài)系統(tǒng)功能提供了重要基礎。近年來,全球及區(qū)域尺度的植物性狀數(shù)據(jù)庫不斷完善,推動了宏觀生態(tài)學、功能生態(tài)學及生物多樣性保護等領域的發(fā)展。然而,現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫主要聚焦于葉片等生長器官,種子、果實等繁殖器官的記錄相對不足,形成顯著的數(shù)據(jù)短板。此外,數(shù)據(jù)的地域分布極不均衡,部分生物多樣性熱點地區(qū)數(shù)據(jù)匱乏,進一步加劇了大尺度生態(tài)學研究中的地理偏倚問題。中國作為全球生物多樣性熱點地區(qū)之一,擁有逾3.5萬種維管植物和多樣化的生態(tài)系統(tǒng),豐富的生物資源促使了大量本土研究的開展,相關成果刊載于眾多中文期刊,積累了數(shù)量可觀的植物傳播體性狀數(shù)據(jù),卻因語言障礙和獲取渠道限制尚未被國際學界廣泛利用。

為突破植物傳播體性狀數(shù)據(jù)在數(shù)量和地域分布上的局限,學科組構建了中國種子性狀數(shù)據(jù)庫(Chinese Seed Trait Database, CSTD),系統(tǒng)整合了694個中文數(shù)據(jù)來源,包括681篇期刊論文、10本專著和3個在線數(shù)據(jù)庫,共收錄110451條數(shù)據(jù)記錄,涵蓋3897種植物(隸屬1416屬、214科),涉及118項性狀,覆蓋中國全部生物區(qū)系。

圖一 各式各樣的種子形態(tài)(學科組拍攝)

圖二 中國種子性狀數(shù)據(jù)庫的結構框架

數(shù)據(jù)庫由三大核心模塊構成:

(1)采樣地點信息,包括地名、地理坐標和氣候數(shù)據(jù)。79%的記錄包含地名信息,66.3%具備精確地理坐標,數(shù)據(jù)分布橫跨45.6°緯度和6000m海拔范圍,具備顯著的大尺度應用潛力。

(2)物種信息,包括分類單元、生活型和生長型。數(shù)據(jù)庫廣泛覆蓋植物類群,其中接近40%的物種擁有10種以上性狀記錄,為系統(tǒng)發(fā)育比較分析提供基礎。

(3)性狀信息,包括性狀名稱、具體數(shù)據(jù)及其單位。CSTD收錄的性狀涵蓋形態(tài)、生理、化學、物候、數(shù)量及傳播六大類,為全面描繪種子性狀綜合征和解析植物繁殖更新策略多樣性提供了重要的數(shù)據(jù)支持。

圖三 中國種子性狀數(shù)據(jù)庫的地理及系統(tǒng)發(fā)育分布

中國種子性狀數(shù)據(jù)庫屬于完全開放獲取,用戶可通過Shiny交互式網(wǎng)頁平臺在線瀏覽、篩選和下載數(shù)據(jù)。歡迎自由使用,使用后請務必引用原文(Wang HY, Chen XL, Chen SC. 2025. Chinese Seed Trait Database: A curated resource for diaspore traits in the Chinese flora. New Phytologist 247: 1-6. http://doi.org/10.1111/nph.70296)

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CSTD通過整合中文文獻中海量而分散的傳播體性狀數(shù)據(jù),有效填補了全球植物功能性狀研究中的Raunki?ran短缺,為植物學、生態(tài)學和進化生物學的宏觀研究提供了寶貴資源。未來,CSTD將持續(xù)更新和拓展,誠邀全球植物學家、生態(tài)學家及相關研究人員共同參與數(shù)據(jù)庫的建設與完善,推動數(shù)據(jù)共享與集成,促進全球種子性狀信息的全面整合與深入應用。

該研究近日以“Chinese Seed Trait Database: A curated resource for diaspore traits in the Chinese flora”為題發(fā)表于主流期刊New Phytologist。中國科學院武漢植物園宏觀生態(tài)學學科組博士研究生王昊羽為論文的第一作者,陳思翀研究員為論文的通訊作者,南昌大學本科生陳雪琳參與了數(shù)據(jù)庫收集工作。本研究受到國家自然科學基金項目和中國科學院“率先行動”引才計劃的資助。

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