哈巴湖國家級(jí)自然保護(hù)區(qū)濕地主要?jiǎng)澐譃樗念悾ê恿鳌⒑础⒄訚?、人工?型（季節(jié)性河流、季節(jié)性咸水湖、內(nèi)陸鹽沼、季節(jié)性咸水沼澤、庫塘）。濕地面積10720.88 公頃，占保護(hù)區(qū)總面積的12.76％，其中河流濕地201.99公頃，湖泊濕地3124.29公頃，沼澤濕地7224.60公頃，人工濕地170公頃。主要有花馬湖濕地、哈巴湖濕地、鐵柱泉濕地、茍池西畔濕地、八字洼硝池灘濕地、二道湖濕地等。